Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms