Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Prdm6Q3UZD5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Prdm6Q3UZD5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Prdm6Q3UZD5 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Prdm6Q3UZD5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Prdm6Q3UZD5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm6Q3UZD5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Prdm6Q3UZD5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Prdm6Q3UZD5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Prdm6Q3UZD5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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