Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnpc3Q3UZ01 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms