Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm29609Q3UU56 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms