Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms