Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms