Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp19Q3UJD6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms