Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf180Q3U827 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf180Q3U827 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rnf180Q3U827 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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