Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssbp4Q3U4B1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ssbp4Q3U4B1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms