Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnnm2Q3TWN3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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