Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp39Q3TIX9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms