Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc13Q3TIR1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms