Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RubcnlQ3TD16 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms