Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

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Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rtl9Q32KG4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rtl9Q32KG4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rtl9Q32KG4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rtl9Q32KG4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rtl9Q32KG4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rtl9Q32KG4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rtl9Q32KG4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rtl9Q32KG4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rtl9Q32KG4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rtl9Q32KG4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rtl9Q32KG4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rtl9Q32KG4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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