Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms