Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cers3Q1A3B0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms