Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Traf3ip1Q149C2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Traf3ip1Q149C2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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