Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc162pQ0VG85 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc162pQ0VG85 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms