Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rundc1Q0VDN7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc1Q0VDN7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms