Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms