Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pate4Q09098 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms