Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SctQ08535 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SctQ08535 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SctQ08535 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SctQ08535 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SctQ08535 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SctQ08535 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SctQ08535 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SctQ08535 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms