Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms