Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn1Q08091 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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