Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cntn3Q07409 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Cntn3Q07409 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntn3Q07409 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntn3Q07409 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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