Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cab39Q06138 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms