Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Apoc2Q05020 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoc2Q05020 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms