Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms