Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Scg2Q03517 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms