Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msx2Q03358 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms