Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp11Q02853 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms