Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms