Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms