Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms