Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms