Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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