Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb2Q00977 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms