Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp4cP97470 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms