Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prop1P97458 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prop1P97458 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms