Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cbx1P83917 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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