Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms