Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SgcdP82347 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SgcdP82347 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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