Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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