Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rps3P62908 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms