Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gabra1P62812 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms