Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl18aP62717 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl18aP62717 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms