Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2kP61087 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms