Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfia3P60469 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms