Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms