Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Atp5eP56382 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms